El Gobierno de José María Aznar entregó a la Fundación Francisco Franco 150.841 euros en ayudas. Lo hizo durante entre los años 2000 y 2003 a cuenta de unas ayudas para entidades privadas sin "ánimo de lucro para el desarrollo de proyecto archivísticos (microfilmación). Así lo reconoce el Gobierno de Mariano Rajoy en una respuesta parlamentaria a En Marea en la que aclara que nunca se han concedido subvención alguna a la Fundación "en régimen de concesión directa". 

Así, el Ejecutivo del Partido Popular entregó a la Fundación del dictador 41.080, 38 euros en el año 2000; 42.070,84, en el 2001; 41.000, en 2002; y 26.690, en 2003. "Consideramos un escándalo que una fundación de este tipo, que hace apología de la dictadura y del fascismo, reciba más de 150.000 euros en apenas tres años”, denuncian los diputados de En Marea Yolanda González y Antón Gómez. 

No obstante, la respuesta del Ejecutivo no ha satisfecho del todo a En Marea que denuncia que su pregunta pedía conocer la cuantía de las ayudas públicas percibidas por la Fundación Francisco Franco desde su constitución, desglosadas por ejercicios fiscales y con indicación concreta de las fechas, conceptos y cuantías abonadas. 

"Nos encontramos con que el Ejecutivo de Rajoy solo explica las ayudas desde el año 2000 al 2003, donde se destinan más de 150000 euros para proyectos archivísticos y/o difusión del patrimonio”, asegura el diputado y portavoz de En Marea en el Congreso, Antón Gómez-Reino, por lo que En Marea considera que "el Gobierno no está facilitando toda la información". 

"Queremos investigar estas cuentas para comprobar si la Fundación recibe otro tipo de ayudas con cargo a fondos públicos para impedir, a través de diversas iniciativas en el Congreso, que esto siga ocurriendo", sentencian los diputados de En Marea.